Organisasi Intra sekolah, SMKN 1 Jetis memiliki beberapa kegiatan diantaranya; OSIS, Pramuka, PKS, PMR, PBB & Bhayangkara/i. Diantara organisasi tersebut memiliki kegiatan masing-masing dan membuat siswa memiliki kemampuan softskill yang baik untuk masa depan mereka nanti. Melalui kemampuan organisator maka para siswa diharapkan mampu bersosialisasi lebih baik dari sebelumnya supaya dapat bersaing dengan masyarakat global.
Kemampuan softskill sangat berguna di lingkungan masyarakat, kerja, maupun pergaulan. Banyak kegiatan yang dapat meningkatkan solidaritas, setia kawan, kekuatan mental, kedisiplinan, rasa cinta sesama, serta masih banyak lagi.
Dari organisasi intra sekolah tersebut melahirkan kegiatan antara lain; Pelatihan Dasar dan Kepemimpinan, Outbond, Perkemahan Sabtu-Minggu (PERSAMI), perlombaan baris berbaris, pelatihan P3K, menyelenggarakan acara sebagai event organizer, dan masih banyak lagi